MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 25374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019848	AGC	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615548
2	NC_019848	AAC	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615548
3	NC_019848	C	6	6	90	95	0 %	0 %	0 %	100 %	433615548
4	NC_019848	CG	3	6	99	104	0 %	0 %	50 %	50 %	433615548
5	NC_019848	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615548
6	NC_019848	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615548
7	NC_019848	CGGC	2	8	219	226	0 %	0 %	50 %	50 %	433615548
8	NC_019848	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615548
9	NC_019848	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615548
10	NC_019848	GGC	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615548
11	NC_019848	TC	3	6	451	456	0 %	50 %	0 %	50 %	433615548
12	NC_019848	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615548
13	NC_019848	CGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615548
14	NC_019848	TCCCG	2	10	534	543	0 %	20 %	20 %	60 %	433615548
15	NC_019848	CAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615548
16	NC_019848	GCG	2	6	642	647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615548
17	NC_019848	CAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615548
18	NC_019848	TCG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615548
19	NC_019848	CCG	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615548
20	NC_019848	TCA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615548
21	NC_019848	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615548
22	NC_019848	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615548
23	NC_019848	TGA	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615548
24	NC_019848	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615548
25	NC_019848	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615548
26	NC_019848	TGC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615548
27	NC_019848	GA	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	433615548
28	NC_019848	TCT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615549
29	NC_019848	CGTC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	25 %	50 %	433615549
30	NC_019848	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615549
31	NC_019848	TCG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615549
32	NC_019848	GATC	2	8	1361	1368	25 %	25 %	25 %	25 %	433615549
33	NC_019848	GCCGGC	2	12	1531	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	433615549
34	NC_019848	CTC	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615549
35	NC_019848	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615549
36	NC_019848	AGG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615549
37	NC_019848	CGC	2	6	1704	1709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615549
38	NC_019848	GCA	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615549
39	NC_019848	CG	3	6	1783	1788	0 %	0 %	50 %	50 %	433615549
40	NC_019848	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615549
41	NC_019848	GATCT	2	10	2004	2013	20 %	40 %	20 %	20 %	433615549
42	NC_019848	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615549
43	NC_019848	GAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615550
44	NC_019848	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615550
45	NC_019848	GTCG	2	8	2428	2435	0 %	25 %	50 %	25 %	433615550
46	NC_019848	TCGC	2	8	2452	2459	0 %	25 %	25 %	50 %	433615550
47	NC_019848	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615550
48	NC_019848	GTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615550
49	NC_019848	CATGG	2	10	2606	2615	20 %	20 %	40 %	20 %	433615550
50	NC_019848	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615550
51	NC_019848	TCG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615550
52	NC_019848	TCGC	2	8	2667	2674	0 %	25 %	25 %	50 %	433615550
53	NC_019848	TCGC	2	8	2747	2754	0 %	25 %	25 %	50 %	433615550
54	NC_019848	CTG	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615550
55	NC_019848	GTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615550
56	NC_019848	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615550
57	NC_019848	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433615550
58	NC_019848	CAA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615550
59	NC_019848	AGG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615550
60	NC_019848	AG	3	6	3394	3399	50 %	0 %	50 %	0 %	433615550
61	NC_019848	CTG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615550
62	NC_019848	G	7	7	3522	3528	0 %	0 %	100 %	0 %	433615550
63	NC_019848	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615551
64	NC_019848	CGG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615551
65	NC_019848	CGA	2	6	3915	3920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615551
66	NC_019848	CGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615551
67	NC_019848	CGG	3	9	3951	3959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615551
68	NC_019848	AGC	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615551
69	NC_019848	CGC	2	6	3990	3995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615551
70	NC_019848	GGC	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615551
71	NC_019848	TGC	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615552
72	NC_019848	CAT	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615553
73	NC_019848	CGG	2	6	4660	4665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615553
74	NC_019848	GCA	2	6	4704	4709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615553
75	NC_019848	CGG	2	6	4759	4764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615553
76	NC_019848	AAT	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433615553
77	NC_019848	GCT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615553
78	NC_019848	GCCT	2	8	4929	4936	0 %	25 %	25 %	50 %	433615553
79	NC_019848	GT	3	6	4959	4964	0 %	50 %	50 %	0 %	433615553
80	NC_019848	AGA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615553
81	NC_019848	CGG	2	6	5055	5060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615553
82	NC_019848	CCG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615553
83	NC_019848	CT	3	6	5255	5260	0 %	50 %	0 %	50 %	433615554
84	NC_019848	GAA	2	6	5339	5344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615554
85	NC_019848	ATT	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433615554
86	NC_019848	TCC	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615554
87	NC_019848	GC	3	6	5517	5522	0 %	0 %	50 %	50 %	433615554
88	NC_019848	GAA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615554
89	NC_019848	TTGGA	2	10	5606	5615	20 %	40 %	40 %	0 %	433615554
90	NC_019848	GCGG	2	8	5619	5626	0 %	0 %	75 %	25 %	433615554
91	NC_019848	CGG	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
92	NC_019848	CGC	2	6	5676	5681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615554
93	NC_019848	TCT	3	9	5706	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615554
94	NC_019848	CGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615554
95	NC_019848	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615554
96	NC_019848	CTT	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615554
97	NC_019848	GAA	2	6	5824	5829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615554
98	NC_019848	CTCG	2	8	5853	5860	0 %	25 %	25 %	50 %	433615554
99	NC_019848	CGG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
100	NC_019848	GGC	2	6	5898	5903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
101	NC_019848	GCG	2	6	5923	5928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
102	NC_019848	CA	3	6	5940	5945	50 %	0 %	0 %	50 %	433615554
103	NC_019848	CCG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615554
104	NC_019848	GAA	2	6	6088	6093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615554
105	NC_019848	GC	3	6	6129	6134	0 %	0 %	50 %	50 %	433615554
106	NC_019848	GC	3	6	6137	6142	0 %	0 %	50 %	50 %	433615554
107	NC_019848	GAACT	2	10	6209	6218	40 %	20 %	20 %	20 %	433615554
108	NC_019848	CCG	2	6	6221	6226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615554
109	NC_019848	CGG	2	6	6257	6262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
110	NC_019848	CCCG	3	12	6271	6282	0 %	0 %	25 %	75 %	433615554
111	NC_019848	TCT	2	6	6363	6368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615554
112	NC_019848	CTG	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615554
113	NC_019848	GCG	2	6	6464	6469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
114	NC_019848	GGC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
115	NC_019848	GCTTTC	2	12	6542	6553	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433615554
116	NC_019848	GCG	2	6	6590	6595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
117	NC_019848	TGC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615554
118	NC_019848	GC	3	6	6606	6611	0 %	0 %	50 %	50 %	433615554
119	NC_019848	CGG	2	6	6630	6635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615554
120	NC_019848	GCT	2	6	6651	6656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615554
121	NC_019848	CGA	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615554
122	NC_019848	ACCA	2	8	6673	6680	50 %	0 %	0 %	50 %	433615554
123	NC_019848	GCT	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615554
124	NC_019848	TCG	3	9	6740	6748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615554
125	NC_019848	ACG	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615554
126	NC_019848	GGT	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615556
127	NC_019848	CGG	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615556
128	NC_019848	GATC	2	8	7146	7153	25 %	25 %	25 %	25 %	433615556
129	NC_019848	GCT	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615556
130	NC_019848	TCGA	2	8	7185	7192	25 %	25 %	25 %	25 %	433615556
131	NC_019848	CG	3	6	7202	7207	0 %	0 %	50 %	50 %	433615556
132	NC_019848	CCG	2	6	7285	7290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615556
133	NC_019848	CAG	2	6	7306	7311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615556
134	NC_019848	ACCGG	2	10	7317	7326	20 %	0 %	40 %	40 %	433615556
135	NC_019848	TCGA	2	8	7336	7343	25 %	25 %	25 %	25 %	433615556
136	NC_019848	ACG	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615556
137	NC_019848	CGC	2	6	7394	7399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615556
138	NC_019848	TCG	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615556
139	NC_019848	CCGT	2	8	7428	7435	0 %	25 %	25 %	50 %	433615556
140	NC_019848	CGA	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615556
141	NC_019848	CAG	3	9	7545	7553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615556
142	NC_019848	GCCG	2	8	7563	7570	0 %	0 %	50 %	50 %	433615556
143	NC_019848	CAT	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615556
144	NC_019848	GTC	2	6	7671	7676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615556
145	NC_019848	GAGG	2	8	7698	7705	25 %	0 %	75 %	0 %	433615556
146	NC_019848	GCCG	2	8	7899	7906	0 %	0 %	50 %	50 %	433615556
147	NC_019848	CGA	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615556
148	NC_019848	ACC	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615556
149	NC_019848	TCA	2	6	7994	7999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615556
150	NC_019848	ACG	3	9	8241	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615557
151	NC_019848	CGA	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615557
152	NC_019848	CGG	2	6	8266	8271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615557
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154	NC_019848	CCGG	2	8	8293	8300	0 %	0 %	50 %	50 %	433615557
155	NC_019848	CAA	2	6	8411	8416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615557
156	NC_019848	TCGC	2	8	8436	8443	0 %	25 %	25 %	50 %	433615557
157	NC_019848	GGC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615557
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160	NC_019848	TGG	2	6	9154	9159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615558
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163	NC_019848	TGCA	2	8	9281	9288	25 %	25 %	25 %	25 %	433615558
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165	NC_019848	TGG	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615558
166	NC_019848	GGC	2	6	9400	9405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615558
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168	NC_019848	CGC	2	6	9431	9436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615558
169	NC_019848	CTGG	2	8	9651	9658	0 %	25 %	50 %	25 %	433615558
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242	NC_019848	GCA	2	6	13951	13956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615561
243	NC_019848	GTA	2	6	14027	14032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615561
244	NC_019848	GCC	2	6	14106	14111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615561
245	NC_019848	TCG	2	6	14139	14144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615561
246	NC_019848	TCA	2	6	14148	14153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615561
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248	NC_019848	GCC	2	6	14252	14257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615561
249	NC_019848	CGATGC	2	12	14260	14271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433615561
250	NC_019848	GAGG	2	8	14291	14298	25 %	0 %	75 %	0 %	433615561
251	NC_019848	CGC	2	6	14302	14307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615561
252	NC_019848	GC	3	6	14311	14316	0 %	0 %	50 %	50 %	433615561
253	NC_019848	CGA	2	6	14341	14346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615561
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256	NC_019848	CTTC	2	8	14503	14510	0 %	50 %	0 %	50 %	433615561
257	NC_019848	CAG	2	6	14513	14518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615561
258	NC_019848	AGC	2	6	14553	14558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615561
259	NC_019848	GGGC	2	8	14630	14637	0 %	0 %	75 %	25 %	433615561
260	NC_019848	GGC	2	6	14644	14649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615561
261	NC_019848	GGC	2	6	14699	14704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615561
262	NC_019848	GCC	2	6	14711	14716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615561
263	NC_019848	GCCG	2	8	14740	14747	0 %	0 %	50 %	50 %	433615561
264	NC_019848	GAT	2	6	14768	14773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615561
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389	NC_019848	CCGC	2	8	19528	19535	0 %	0 %	25 %	75 %	433615565
390	NC_019848	GGCG	2	8	19554	19561	0 %	0 %	75 %	25 %	433615565
391	NC_019848	GCC	3	9	19637	19645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615565
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497	NC_019848	GTT	2	6	26997	27002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615572
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499	NC_019848	GCC	2	6	27064	27069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615572
500	NC_019848	CG	3	6	27081	27086	0 %	0 %	50 %	50 %	433615572

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